Форум uaDNA | uaDNA Forum

Питання українського ДНК-родоводу | Matters of the Ukrainian DNA-genealogy
It is currently 26 May 2018, 23:04

All times are UTC - 5 hours [ DST ]




Post new topic Reply to topic  [ 5 posts ] 
Author Message
PostPosted: 15 Jun 2015, 22:02 
Offline
Адмін сайту | Site Admin
User avatar

Joined: 15 Apr 2014, 12:02
Posts: 129
Population genomics of Bronze Age Eurasia | Популяційна геноміка Євразії бронзової доби

Morten E. Allentoft, Martin Sikora, Karl-Göran Sjögren, Simon Rasmussen, Morten Rasmussen, Jesper Stenderup, Peter B. Damgaard, Hannes Schroeder, Torbjörn Ahlström, Lasse Vinner, Anna-Sapfo Malaspinas, Ashot Margaryan, Tom Higham, David Chivall, Niels Lynnerup, Lise Harvig, Justyna Baron, Philippe Della Casa, Paweł Dąbrowski, Paul R. Duffy, Alexander V. Ebel, Andrey Epimakhov, Karin Frei, Mirosław Furmanek, Tomasz Gralak et al.

Nature 522, 167–172 (11 June 2015) doi:10.1038/nature14507

Abstract
The Bronze Age of Eurasia (around 3000–1000 BC) was a period of major cultural changes. However, there is debate about whether these changes resulted from the circulation of ideas or from human migrations, potentially also facilitating the spread of languages and certain phenotypic traits. We investigated this by using new, improved methods to sequence low-coverage genomes from 101 ancient humans from across Eurasia. We show that the Bronze Age was a highly dynamic period involving large-scale population migrations and replacements, responsible for shaping major parts of present-day demographic structure in both Europe and Asia. Our findings are consistent with the hypothesized spread of Indo-European languages during the Early Bronze Age. We also demonstrate that light skin pigmentation in Europeans was already present at high frequency in the Bronze Age, but not lactose tolerance, indicating a more recent onset of positive selection on lactose tolerance than previously thought.

Анотація
Бронзова доба у Євразії (близько 3000-1000 до н.е.) була періодом великих культурних змін. Однак, триває суперечка про те, чи ці зміни відбулися внаслідок кругообігу ідей чи переселення людей, що потенційно сприяло поширенню мов і певних фенотипічних ознак. Ми дослідили це, скориставшись новими вдосконаленими методами секвенування геномів низького покриття 101 стародавньої людини з усієї Євразії. Ми показуємо що бронзова доба була дуже динамічним періодом, що залучала широкомасштабні міграції населення й заміни, відповідальні за формування основних частин сучасної демографічної структури як у Європі, так і в Азії. Наші знахідки узгоджуються з передбачуваним поширенням індо-європейських мов під час ранньої бронзової доби. Ми також показуємо, що пігментація світлої шкіри у європейців була вже присутня з високою частотою в бронзову добу, але не терпимість до лактози, що вказуює на більш недавній початок позитивної селекції на терпимості до лактози, ніж вважалося раніше.

_________________
R-YP591 | HV1a2
The Ukrainian DNA Project - Проект "Українська ДНК" | Sloboda-Yaltushkivska DNA Project - ДНК-Проект "Слобода-Ялтушківська" | Bodnar Y-DNA Surname Project - Y-ДНК-проект прізвища Боднар


Top
 Profile  
 
PostPosted: 17 Jun 2015, 14:30 
Offline
Адмін сайту | Site Admin
User avatar

Joined: 15 Apr 2014, 12:02
Posts: 129
Ancient DNA and the Indo-European Question
by Paul Heggarty, Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Leipzig.
http://dlc.hypotheses.org/807

_________________
R-YP591 | HV1a2
The Ukrainian DNA Project - Проект "Українська ДНК" | Sloboda-Yaltushkivska DNA Project - ДНК-Проект "Слобода-Ялтушківська" | Bodnar Y-DNA Surname Project - Y-ДНК-проект прізвища Боднар


Top
 Profile  
 
PostPosted: 19 Jun 2015, 16:38 
Offline
Адмін сайту | Site Admin
User avatar

Joined: 15 Apr 2014, 12:02
Posts: 129
Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe | Масова міграція зі степу була джерелом індо-європейських мов у Європі

Wolfgang Haak, Iosif Lazaridis, Nick Patterson, Nadin Rohland, Swapan Mallick, Bastien Llamas, Guido Brandt, Susanne Nordenfelt, Eadaoin Harney, Kristin Stewardson, Qiaomei Fu, Alissa Mittnik, Eszter Bánffy, Christos Economou, Michael Francken, Susanne Friederich, Rafael Garrido Pena, Fredrik Hallgren, Valery Khartanovich, Aleksandr Khokhlov, Michael Kunst, Pavel Kuznetsov, Harald Meller, Oleg Mochalov, Vayacheslav Moiseyev et al.

Nature 522, 207–211 (11 June 2015) doi:10.1038/nature14317 (http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/abs/nature14317.html)

Abstract
We generated genome-wide data from 69 Europeans who lived between 8,000–3,000 years ago by enriching ancient DNA libraries for a target set of almost 400,000 polymorphisms. Enrichment of these positions decreases the sequencing required for genome-wide ancient DNA analysis by a median of around 250-fold, allowing us to study an order of magnitude more individuals than previous studies and to obtain new insights about the past. We show that the populations of Western and Far Eastern Europe followed opposite trajectories between 8,000–5,000 years ago. At the beginning of the Neolithic period in Europe, ~8,000–7,000 years ago, closely related groups of early farmers appeared in Germany, Hungary and Spain, different from indigenous hunter-gatherers, whereas Russia was inhabited by a distinctive population of hunter-gatherers with high affinity to a ~24,000-year-old Siberian. By ~6,000–5,000 years ago, farmers throughout much of Europe had more hunter-gatherer ancestry than their predecessors, but in Russia, the Yamnaya steppe herders of this time were descended not only from the preceding eastern European hunter-gatherers, but also from a population of Near Eastern ancestry. Western and Eastern Europe came into contact ~4,500 years ago, as the Late Neolithic Corded Ware people from Germany traced ~75% of their ancestry to the Yamnaya, documenting a massive migration into the heartland of Europe from its eastern periphery. This steppe ancestry persisted in all sampled central Europeans until at least ~3,000 years ago, and is ubiquitous in present-day Europeans. These results provide support for a steppe origin of at least some of the Indo-European languages of Europe.

Анотація
Ми згенерували широкогеномні дані від 69 європейців, що жили між 8,000 і 3,000 років тому шляхом збагачення збагачення бібліотеки древньої ДНК для цільового набору майже 400000 поліморфізмів. Збагачення цих позицій знижує секвенування, необхідне для широкогеномного аналізу древньої ДНК в середньому близько 250-кратно, що дозволяє нам вивчати на порядок більше людей, ніж у попередніх дослідженнях і отримати нові знання про минуле. Ми показуємо, що населення Західної та Далекосхідної Європи слідувало протилежним траєкторіям між 8,000 і 5,000 років тому. На початку неоліту в Європі, ~ 8,000-7,000 років тому, тісно пов'язані групи ранніх землеробів, що з'явилися в Німеччині, Угорщині та Іспанії, відрізняються від корінних мисливців-збирачів, у той час як Росія була заселена відмінним населення мисливців-збирачів з високою спорідненістю до ~24000-річного сибіряка. До ~ 6,000-5,000 років тому, фермери в більшості країн Європи були більше мисливце-збирацького походження, ніж їхні попередники, але в Росії, ямні степові скотарі цього часу походили не тільки від попередніх східно-європейських мисливціі-збирачів, але також від населення близько-східного походження. Західна і Східна Європа зіткнулися ~ 4500 років тому, так як для людей шнурової кераміки пізнього неоліту з Німеччини простежується ~ 75% їхнього походження до Ямної, документуючи масову міграцію в серце Європи з її східної периферії. Це степове походження зберігається у всіх відібраних центральних європейців принаймні до ~ 3000 років тому, і є повсюдним у сучасних європейців. Ці результати забезпечують підтримку для степового походження принаймні деяких з індо-європейських мов Європи.

_________________
R-YP591 | HV1a2
The Ukrainian DNA Project - Проект "Українська ДНК" | Sloboda-Yaltushkivska DNA Project - ДНК-Проект "Слобода-Ялтушківська" | Bodnar Y-DNA Surname Project - Y-ДНК-проект прізвища Боднар


Top
 Profile  
 
PostPosted: 03 Sep 2015, 11:55 
Offline
Адмін сайту | Site Admin
User avatar

Joined: 15 Apr 2014, 12:02
Posts: 129
Genetic Heritage of the Balto-Slavic Speaking Populations: A Synthesis of Autosomal, Mitochondrial and Y-Chromosomal Data | Генетична спадщина балто-слов'янських мовних популяцій: Синтез аутосомних, мітохондріальних і Y-хромосомних даних

Alena Kushniarevich, Olga Utevska, Marina Chuhryaeva, Anastasia Agdzhoyan, Khadizhat Dibirova, Ingrida Uktveryte, Märt Möls, Lejla Mulahasanovic, Andrey Pshenichnov, Svetlana Frolova, Andrey Shanko, Ene Metspalu, Maere Reidla, Kristiina Tambets, Erika Tamm, Sergey Koshel, Valery Zaporozhchenko, Lubov Atramentova, Vaidutis Kučinskas, Oleg Davydenko, Olga Goncharova, Irina Evseeva, Michail Churnosov, Elvira Pocheshchova, Bayazit Yunusbayev, Elza Khusnutdinova, Damir Marjanović, Pavao Rudan, Siiri Rootsi, Nick Yankovsky, Phillip Endicott, Alexei Kassian, Anna Dybo, The Genographic Consortium, Chris Tyler-Smith, Elena Balanovska, Mait Metspalu, Toomas Kivisild, Richard Villems, Oleg Balanovsky

Abstract
The Slavic branch of the Balto-Slavic sub-family of Indo-European languages underwent rapid divergence as a result of the spatial expansion of its speakers from Central-East Europe, in early medieval times. This expansion–mainly to East Europe and the northern Balkans–resulted in the incorporation of genetic components from numerous autochthonous populations into the Slavic gene pools. Here, we characterize genetic variation in all extant ethnic groups speaking Balto-Slavic languages by analyzing mitochondrial DNA (n = 6,876), Y-chromosomes (n = 6,079) and genome-wide SNP profiles (n = 296), within the context of other European populations. We also reassess the phylogeny of Slavic languages within the Balto-Slavic branch of Indo-European. We find that genetic distances among Balto-Slavic populations, based on autosomal and Y-chromosomal loci, show a high correlation (0.9) both with each other and with geography, but a slightly lower correlation (0.7) with mitochondrial DNA and linguistic affiliation. The data suggest that genetic diversity of the present-day Slavs was predominantly shaped in situ, and we detect two different substrata: ‘central-east European’ for West and East Slavs, and ‘south-east European’ for South Slavs. A pattern of distribution of segments identical by descent between groups of East-West and South Slavs suggests shared ancestry or a modest gene flow between those two groups, which might derive from the historic spread of Slavic people.

Аннотація
Слов'янська гілка балто-слов'янської підродини індоєвропейських мов зазнала швидкого рохзходження в результаті просторового розширення її носіїв мови з Центрально-Східної Європи, на початку середньовіччя. Це розширення - в основному в Східній Європі та північних Балканах - привело до включення генетичних компонентів з численних автохтонних популяцій у слов'янські генофонди. Тут ми характеризуємо генетичну зміну у всіх існуючих етнічних групах, що говорять на балто-слов'янськими мовами, аналізуючи мітохондріальну ДНК (п = 6,876), Y-хромосоми (п = 6 079) і геномні SNP-профілі (п = 296), у контексті інших європейських популяціях. Ми також переглядаємо філогенію слов'янських мов у балто-слов'янській гілці індо-європейської. Ми знаходимо, що генетичні відстані між балто-слов'янськими популяціями, засновані на аутосомних і Y-хромосомних локусах, показують високу кореляцію (0.9) і один з одним, і з географією, але трохи нижчу кореляцію (0.7) з мітохондріальною ДНК і мовною приналежністю. Ці дані свідчать про те, що генетична різноманітність сучасних слов'ян була переважно сформована на місці, і ми виявляємо два різні субстрати: "центрально-східноєвропейський" для західних і східних слов'ян, і "південно-східноєвропейський" для південних слов'ян. Шаблон розподілу сегментів однакових за походженням між групами східних/західних і південних слов'ян пропонує спільний родовід або скромний потік генів між цими двома групами, який міг би бути походити з історичного поширення слов'янських народів.

DOI: 10.1371/journal.pone.0135820

Джерела | Sources
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0135820
PDF: http://www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info:doi/10.1371/journal.pone.0135820&representation=PDF
http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=4440
PDF: http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=4440&get_pdf=1

_________________
R-YP591 | HV1a2
The Ukrainian DNA Project - Проект "Українська ДНК" | Sloboda-Yaltushkivska DNA Project - ДНК-Проект "Слобода-Ялтушківська" | Bodnar Y-DNA Surname Project - Y-ДНК-проект прізвища Боднар


Top
 Profile  
 
PostPosted: 09 Jun 2016, 12:24 
Offline
Адмін сайту | Site Admin
User avatar

Joined: 15 Apr 2014, 12:02
Posts: 129
Популяції Закарпаття і Буковини на генетичному тлі довколишніх територій | Популяции Закарпатья и Буковины на генетическом фоне окружающих территорий | Populations of Transcarpathia and Bukovina on the genetic landscape of surrounding regions
Джерело | Source: Vìsn. Dnìpropetr. Unìv. Ser. Bìol. Med. 2015. 6(2), 133–140.
doi:10.15421/021524
---------------------------------------------------------

Популяції Закарпаття й Буковини на генетичному тлі довколишніх територій

О.М. Утевська, М.І. Чухряєва, А.Т. Агджоян, Л.А. Атраментова, Е.В. Балановська, О.П. Балановський

Аннотація
Вивчена генетична структура Закарпатської і Чернівецької популяцій українців за SNP-маркерами нерекомбінаційної частини Y хромосоми. У Закарпатті з частотами більше 5% зустрічались такі гаплогрупи Y-хромосоми: R1a1a1*(М198), I2a (Р37.2), R1a1a1g (М458), E1b1b1a1 (M78). У Чернівецькій області спектр мажорних гаплогруп був іншим: з частотами більше 5% зустрічались гаплогрупи I2a (Р37.2), R1a1a1*(М198), R1a1a1g (М458), R1b1b2 (М269), E1b1b1a1 (M78), I1 (М253), суммарно складаючи біля 90% Y-хромосомного генофонду. Чернівецька популяція відрізняється від типовх популяцій українців високою частотою гаплогрупи I2a (Р37.2) й пониженою частотою гаплогрупи R1a (М198). Такі генетичні особливості, очевидно, сформувались за рахунок включення генетичних компонент сусідніх молдованів і румунів. Незважаючи на крайнє розташування в етнічному українському ареалі і на складну демографічну історію, обидві популяції – Чернівецька й Закарпатська – за маркерами Y-хромосоми утворюють спільну область генетичної схожості з рештою українських популяцій і є частиною цілого українського генофонду. Карпати є географічним бар'єром для поширення низки гаплогруп Y-хромосоми на території Східної Європи. Вони обмежують потік N1c (М178) і R1a (М198) з північного сходу і поширення E1b (М78), R1b (М269), J (М304) та G (М201) з південного заходу.

Ключові слова: українці; SNP-маркери; Y-хромосома; гаплогрупи; генетичні відстані

---------------------------------------------------------

Популяции Закарпатья и Буковины на генетическом фоне окружающих территорий

О.М. Утевская, М.И. Чухряева, А.Т. Агджоян, Л.А. Атраментова, Е.В. Балановская, О.П. Балановский

Аннотация
Изучена генетическая структура Закарпатской и Черновицкой популяций украинцев по SNP маркерам нерекомбинирующей
части Y хромосомы. В Закарпатье с частотами более 5% встречались следующие гаплогруппы Y хромосомы: R1a1a1*(М198), I2a (Р37.2), R1a1a1g (М458), E1b1b1a1 (M78). В Черновицкой области спектр мажорных гаплогрупп был иной: с частотами более 5% встречались гаплогруппы I2a (Р37.2), R1a1a1*(М198), R1a1a1g (М458), R1b1b2 (М269), E1b1b1a1 (M78), I1 (М253), суммарно составляя около 90% Y-хромосомного генофонда. Черновицкая популяция отличается от типичных популяций украинцев высокой частотой гаплогруппы I2a (Р37.2) и пониженной частотой гаплогруппы R1a (М198). Такие генетические особенности, по-видимому, сформировались за счет включения генетических компонентов соседних молдаван и румын. Несмотря на краевое положение в этническом украинском ареале и на сложную демографическую историю, обе популяции – Черновицкая и Закарпатская – по маркерам Y хромосомы образуют единую область генетического сходства с остальными украинскими популяциями и являются частью цельного украинского генофонда. Карпаты являются географическим барьером для распространения ряда гаплогрупп Y хромосомы на территории Восточной Европы. Они ограничивают поток N1c (М178) и R1a (М198) с северо-востока и распространение E1b (М78), R1b (М269), J (М304) и G (М201) с юго-запада.


Ключевые слова: украинцы; SNP маркеры; Y хромосома; гаплогруппы; генетические расстояния

---------------------------------------------------------

Populations of Transcarpathia and Bukovina on the genetic landscape of surrounding regions

O.M. Utevska, M.I. Chukhraeva, A.T. Agdzhoyan, L.A. Atramentova, E.V. Balanovska, O.P. Balanovsky

Abstract
The territory of present-day Ukraine is subdivided into some regions with specific demographic and politic history. Nevertheless, the corresponding subdivision in genetic structure is not revealed in previous investigations: populations of Ukrainians under study were genetically homogeneous on SNP markers of Y chromosome. In the current investigation we studied the Y-chromosomal genetic structure of Transcarpathia and Bukovina populations. Several factors exist to expect the genetic specificity of these populations. Both ones are placed in the Carpathian foothills, at the south-western border of the Ukrainian area. During the last millennium these territories were the parts of different states and were open for ethnically diverse migrations. It was revealed that the major Y chromosomal haplogroups in Transcarpathia population were R1a1a1*(М198), I2a (Р37.2), R1a1a1g (М458), E1b1b1a1 (M78). The major haplogroups in Bukovina population were I2a (Р37.2), R1a1a1*(М198), R1a1a1g (М458), R1b1b2 (М269), E1b1b1a1 (M78), I1 (М253). The Bukovina population differs from the typical Ukrainian population by higher frequency of I2a (Р37.2) and lower frequency of R1a1a1*(М198). Moreover, this is the only population among ones studied in Ukraine where the most frequent haplogroup is I2a (Р37.2) but not R1a1a1*(М198). Such a deviation can be caused by possible mixing with neighbouring southern groups, and Carpathian mountains were not a border for exchange in this case. Interestingly, the haplogroup N1c (M178) is not revealed in Transcarpathia at all, obviously due to the mountain barrier. It was revealed by principal component analysis that Ukrainians from Transcarpathia and Bukovina despite some specific peculiarities are more similar to other Ukrainian populations than to the surrounding ethnic groups such as Poles, Slovaks, Hungarians, Romanians, Moldavians and Gagauzes. Ukrainians of Transcarpathia and Bukovina form the entire genetic continuum with the whole Ukraine on maps of gene distances, confirming the homogeneity of Ukrainian parental gene pool and it’s differentiation from other groups. After performing the analysis of Y-haplogroup spatial distribution, it is supposed that the northern ridges of Carpathian mountains are the East-European barrier decreasing the gene flow. It decreases the spreading of haplogroups N1c (М178) and R1a (М198) southward and movement of E1b (М78), R1b (М269), J (М304) and G (М201) northward.

Keywords: Ukrainians; SNP markers; Y chromosome; haplogroups; Nei distances


Attachments:
File comment: Популяції Закарпаття й Буковини на генетичному тлі довколишніх територій
922-1450176147.pdf [656.07 KiB]
Downloaded 115 times

_________________
R-YP591 | HV1a2
The Ukrainian DNA Project - Проект "Українська ДНК" | Sloboda-Yaltushkivska DNA Project - ДНК-Проект "Слобода-Ялтушківська" | Bodnar Y-DNA Surname Project - Y-ДНК-проект прізвища Боднар
Top
 Profile  
 
Display posts from previous:  Sort by  
Post new topic Reply to topic  [ 5 posts ] 

All times are UTC - 5 hours [ DST ]


Who is online

Users browsing this forum: No registered users and 1 guest


You cannot post new topics in this forum
You cannot reply to topics in this forum
You cannot edit your posts in this forum
You cannot delete your posts in this forum
You cannot post attachments in this forum

Search for:
Jump to:  
cron
Powered by phpBB® Forum Software © phpBB Group